通風柜的排風系統(system)可分為集中式和分散式兩種。集中式是把一層樓面或幾層樓面的的通風柜組成一個系統，或者整個實驗樓分成一二個系統。它的特點是通風機（Draught Fan）少，設備投資（意義：是未來收益的累積）省，而且對通風柜的數量稍有增減，以及位置的變更，都具有一定的適應性。然而由于系統較大，風量不易平衡，盡管每個通風柜上都裝有調節閥，但使用不方便，并且也不容易達到預定的效果。如果系統風管損壞需要檢修時，那么整個系統的通風柜就沒有辦法使用。所以，原來采用集中式系統的實驗室，先后都改為用分散式系統。 
    分散式是把一個通風柜或同房間的幾個通風柜組成一個排風系統。P4實驗室結構和設施、安全操作規程、安全設備適用于對人體具有高度的危險性，通過氣溶膠途徑傳播或傳播途徑不明，尚無有效的疫苗或治療方法的致病微生物及其毒素。他的特點是：可根據通風柜的工作需要來啟閉通風機，相互不受干擾，容易達到預定的效果，而且比集中式節省(spare)能源，因為集中式系統，只要一個通風柜在使用，就得開動大通風機。分散式由于系統小，排風量也小，阻力也小，所以通風機的風量、風壓都不大，躁聲與振動相應也較小。分散式還有一個特點，是對排出不同性質的有害氣體易于處理。缺點是通風機的數量多、系統多，如果通風機集中于通風機房內，那么投資就會增大，如果通風機分散布置，而且就地安裝，雖然通風機的投資增加，但風管的投資可節省，最后總投資不一定增大。建議使用分散式。     在劃分系統時，同一個房間內如有兩個以上的通風柜，應劃為一個系統，避免一個通風柜在使用，其他的通風柜產生倒流，使室內受到感染。同樣，一個房間內除了一個排風系統外，不宜再裝置其他排風設備。 
    工廠實驗室排風系統的通風機（Draught Fan），一般都裝在屋頂上，或頂層的通風機房內，這樣可不占用使用面積，而且使室內的排風管道處于負壓狀態，以免有害物質由于管道的腐蝕或損壞，以及由于管道不嚴密而滲入室內，此外，通風機安裝在屋頂上或頂層的通風機房內，檢修方便，易于消聲或減振。實驗室設備實驗脊椎動物生物安全防護實驗室，其適用微生物范圍與同級的一般生物安全防護實驗室相同。 
    排風系統(system)有害物質排放高度應按現行的《工業公司設計衛生標準》和《工業三廢排放標準》執行。實驗室設備每類生物安全防護實驗室根據所處理的微生物及其毒素的危害程度各分為四級。各級實驗室的生物安全防護要求依次為：一級最低，四級最高。在一般情況下，如果附近五十米以內沒有比較高建筑物時，排放高度應超過建筑物最高處兩米以上。