平均每1~2年發(fā)生一次傳染病重大疫情，如2003年的重癥急性呼吸綜合征（SARS冠狀病毒），2005年的禽流感病毒（HSN1禽流感病毒）, 2008年的手足口（腸道病毒），2011年的發(fā)熱伴血小板綜合征（新布尼亞病毒），2013年的流感病毒（H7N9病毒），2014年的禽流感（H10N8病毒）和埃博拉病毒，2015年禽流感病毒（H5N6病毒），2016年的塞卡病毒，以及目前的新型冠狀病毒肺炎（COVID-19病毒）。疫情爆發(fā)突出表現(xiàn)為發(fā)病急、進展快、傳染性強，因而傳染病病原體的快速、準確鑒定，成控制疫情關(guān)鍵因素。此類疾病的診斷大部分是通過核酸擴增的方式來實現(xiàn)檢測的，而該過程均需要在高標準的PCR實驗室中由專業(yè)人士操作完成，因而PCR實驗室在傳染病重大疫情防控中的疾病診斷和服務(wù)成為不可或缺的力量。除了病毒類傳染病，PCR實驗室可開展的病原微生物檢測包括細菌類、真菌類以及原生動物等疾病的診斷，如臨床常見的巨細胞病毒、EB病毒、結(jié)核分枝桿菌、甲乙型流感病毒肺炎、支原體及衣原體感染、乙肝、丙肝、戊肝等，PCR實驗室在疾病診斷和控制中起到極為重要的作用。

標準的PCR實驗室分為四個區(qū)域:試劑貯存和準備區(qū)、樣品處理區(qū)、核酸擴增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū)。為避免交叉污染,進入各個工作區(qū)域必須嚴格遵循單一方向進行,即只能從試劑貯存和準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴増反應(yīng)混合物配制和擴增區(qū)→擴增產(chǎn)物分析區(qū)各實驗區(qū)之間的試劑及樣品傳遞應(yīng)通過傳遞窗進行。