1. 洗滌室：有專門清洗區域，配有自來水，蒸餾水。對一些試管、BD管、培養皿等玻璃儀器進行洗滌，洗滌后送入滅菌室進行干熱濕熱滅菌。
2. 滅菌室：配有干熱箱和濕熱滅菌鍋，對清洗過的實驗器材和玻璃儀器進行干熱和濕熱滅菌。
3. 種子室：配有超凈工作臺、恒溫臥式搖床、恒溫培養箱、-70℃冰箱。用以接菌、為發酵提供種子以及進行菌體的低溫保存。
4. 發酵室：配有液體發酵罐，用以中試規模的菌體發酵。
5. 離心式：配有低溫高速及低溫中速離心機，用以對菌體培養基進行離心，收集菌體，為蛋白粗純做準備。
6. 粗純室：配有高壓破碎儀.對收集的菌體細胞進行破碎，使之表達的胞內蛋白釋放出來。
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